Наибольшей плотностью речной сети отмечены экваториальные и субэкваториальные широты. Очень мало рек в пустынях. Крупные реки, протекающие по ним, берут начало во влажных областях. В пустынях встречаются сухие русла рек - вади, что наполняются водой только после редких сильных дождей. Большая часть рек Африки имеет дождевое питание, поэтому наивысшие уровни воды на них наблюдаются в сезон дождей. Площадь бассейна Атлантического океана значительно больше площади бассейна Индийского океана. Реки, протекающие по плоскогорьях и прорезают твердые кристаллические породы, образующие многочисленные пороги и водопады. Около трети территории материка относится к бассейну внутреннего стока. Глубоко под пустынями находятся большие запасы подземных вод. Главные речные системы Нил (6671 км) - самая длинная река в мире. Он начинается на Восточно-Африканском плоскогорье рекой Кагера. Из озера Альберт Нил вытекает на равнины, где получает название Белый Нил. У Хартума Белый Нил сливается с Голубым Нилом, который начинается на Абиссинском нагорье, и называется просто Нил. Он всегда полноводный, особенно летом и осенью. Конго - самая полноводная река восточного полушария, что связано с географическим положением бассейна реки и режимом осадков на его площади. Она дважды пересекает экватор. Нигер берет начало на Гвинейском возвышенности и впадает в Гвинейский залив. Крупнейшими реками Южной Африки является Оранжевая и Замбези. Озера Большая часть озер сосредоточена в средней части материка. Озера находятся по линии Великих Восточно-Африканских разломов, глубокие и окружены высокими крутыми горами; имеют значительную длину. Озеро Виктория - самое большое по площади озеро Африки, оно лежит в тектоническом прогибе на высоте 1 134 м. Наибольшие глубины озера Чад достигают 7 м. Следы сухих русел свидетельствуют о другие климатические условия в былые времена. В пустынях и полупустынях имеются подземные водоносные горизонты, в которых содержатся большие запасы подземных вод.